Западно-Алтайский заповедник был создан в 1992 году для сохранения уникальной природной зоны — черневой тайги. Ее характерная особенность заключается в практически полном отсутствии мохового слоя и сильно развитом травяном покрове. В первом ярусе леса преобладает пихта, а во втором — лиственные породы. Кроме леса в заповеднике представлены и другие природные зоны: горные луга, тундра, есть ледники. Также на территории расположено несколько небольших озер.

Общая площадь заповедной территории составляет 86 122 гектаров. В Западно-Алтайском заповеднике существует четырнадцать ледников, которые занимают площадь около 1,1 квадратных километра.

Эта местность покрыта лесами. Одна из достопримечательностей заповедника — Каменный город, являющийся скоплением гранитных останцев. Они представляют собой живописные геологические образования, формировавшиеся на протяжении многих веков, под воздействием атмосферных явлений.

Растительный мир заповедника является одним из самых богатых на всей территории Казахстана. Здесь было выявлено 883 вида сосудистых растений, из которых около сотни видов являются редкими. Из них 27 видов местных растений занесены в Красную книгу республики. В местных лесах произрастают более 230 видов грибов, некоторые из которых встречаются исключительно в этом районе. Более 10% всей флоры заповедника нуждается в государственной охране.

На территории Западно-Алтайского заповедника проживает около 220 видов животных, в том числе редких. Млекопитающие представлены 55 видами. Самыми распространенными и крупными животными являются медведь и лиса, реже встречается рысь. Волки появились в этом районе относительно недавно, в начале 1980-х года, обитают у истоков рек Тургусун и Уба. Очень редко можно встретить росомаху. Из ценных пушных зверей, обитающих в лесах этого района, следует отметить солонгоя, колонок и соболя. В акваториях рек заповедника в большом количестве встречается американская норка и выдра.

Пернатых было зарегистрировано 152 вида, из которых в самом заповеднике гнездятся 120. В Красную книгу Казахстана из них занесено 6 видов: балобан, филин, серый журавль, сапсан, беркут и черный аист. Самыми распространенными птицами этой местности являются щур, певчий дрозд, соловей красношейка, кедровка и различные виды воробьиных. Из самых необычных и красивых пернатых следует отметить синего соловья и синехвостку. В лесах встречаются дятлы, вертишейха, глухари, тетеревы, в акваториях — разнообразные виды уток. В реках и озерах обитают голец, сибирский хариус, лягушки и жабы обыкновенные. Из рептилий были зафиксированы ящерицы, степные гадюки и ужи.