Территория будущего Жарсор-Уркашского заказника была исследована в 1998 - 2000 г., при проведении инвентаризации водно-болотных угодий Костанайской области и предложена для организации особо охраняемой природной территории (Проект Всемирного фонда дикой природы). Группа соленых и небольших пресных озер в окружении песчано-ковыльных степей на востоке Камыстинского района была выделена как место концентрации большого количества пролетных журавлей и других водно-болотных птиц. В 2007 г. Жарсор-Уркашские озера, названные по двум наиболее крупным водоемам, были включены в международный список ключевых орнитологических территорий, а также в международную сеть территорий для стерха и других околоводных птиц Западной и Центральной Азии.В 2008 г.вышло постановление об организации Жарсор-Уркашского комплексного республиканского заказника под управлением Наурзумского заповедника.  В 2009г. Жарсор-Уркашский заказник вошел в список водно-болотных угодий международного значения.

Площадь заказника составляет чуть больше 41 тыс. га, из которых 3700 га находятся под акваторией озер. Наиболее крупные соленые озера - Жарсор и Уркаш - лежат в глубоких котловинах с крутыми, местами обрывистыми, берегами. Из пресных озер имеются озеро Аксу и расположенные недалеко от границ участка озера Кунаксор, Акбай и Батпакколь.

Район озера Жарсор является местом регулярных остановок стерхов. В 1997 - 2006 годах здесь известно, по меньшей мере, 4 встречи одиночки и пары стерхов в период весеннего и осеннего пролета. Но особенно большое значение эта территория имеет для серых журавлей.   В период осеннего пролета здесь образуются массовые скопления серых журавлей, а в отдельные годы также красавок. Общая численность журавлей, останавливающихся на участке, в 1998-2001 гг. оценивалась в 15-20 тыс. особей. Пролет журавлей в отдельные годы растягивался с середины – конца августа до начала октября.

Кроме журавлей на берегах соленых озер в период сезонных миграций, особенно весной, останавливаются на кормежку десятки тысяч северных видов куликов. В конце пролета 9.06.2000 г. в южной части оз. Жарсор кормилось 3,5 тыс.  куликов-воробьев, краснозобиков, чернозобиков, белохвостых песочников и турухтанов. В конце мая 2001 г. в этом же месте было отмечено около 11,2 тыс. куликов, в том числе, кроме выше названных, круглоносый плавунчик, песчанка, камнешарка, мородунка, тулес и другие.

Осенью в большом числе останавливаются, в основном на оз. Батпакколь, серые и белолобые гуси, а также глобально угрожаемые – гусь пискулька и краснозобая казарка. В конце 1990-х годов численность гусей пискулек в отдельные дни сентября достигала 620-740 особей, краснозобых казарок – 1500 особей, что составляет более 2% Сибирско-Каспийской субпопуляции гусей пискулек и более 1% мировой популяции краснозобых казарок. В 2005 г. зарегистрировано 107 пискулек и 384 краснозобых казарки.